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Bonjour,
J'ai besoin d'une petite précision concernant la fragmentation préalable des peptides des grandes tailles.
Dans le cours, il est écrit : "Toutes les endopeptidases (pepsine, trypsine et chymotrypsine) ne fonctionnent pas si la Proline est derrière l'acide aminé coupé."
je comprend pas trop cette phrase
pour la Pepsine par exemple est ce que ça veut dire que :
P-X | W on coupe pas ou
P | W on coupe pas ou même
(X AA quelconque)
je suis complètement perdue
quelqu'un peut m'expliquer svp
Fragmentation préalable des peptides de grande taille
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marieprati
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Salut, Je suis pas tutrice mais je vais quand même essayé de t'expliquer
Oui en fait les endopeptidases ne peuvent pas couper APRES une proline (P)
Petit rappel:
Pepsine -> Coupe à gauche les aa donc inactive si proline AVANT les aa
Trypsine et Chymotrypsine -> coupent à droite les aa donc inactive si proline APRES les aa
Ex: R-P-F-W-P la pepsine donne -> R-P-F-|W-P du coup on obtient 2 fragments
Même exemple mais avec la chymotrypsine -> R-P-F|-W-P pareil on obtient 2 fragments
Je t'ai mis en rouge où la proline empêche le clivage du peptide
Du coup pour ton 1er exemple c'est juste uniquement si X n'est pas la proline
Pour ton 2ème exemple ça ne coupera pas pour la pepsine mais par contre ça marche pour la chymotrypsine puisque la Proline est avant
J'espère que ça va t'aider et que je me suis pas trompé
Oui en fait les endopeptidases ne peuvent pas couper APRES une proline (P)
Petit rappel:
Pepsine -> Coupe à gauche les aa donc inactive si proline AVANT les aa
Trypsine et Chymotrypsine -> coupent à droite les aa donc inactive si proline APRES les aa
Ex: R-P-F-W-P la pepsine donne -> R-P-F-|W-P du coup on obtient 2 fragments
Même exemple mais avec la chymotrypsine -> R-P-F|-W-P pareil on obtient 2 fragments
Je t'ai mis en rouge où la proline empêche le clivage du peptide
Du coup pour ton 1er exemple c'est juste uniquement si X n'est pas la proline
Pour ton 2ème exemple ça ne coupera pas pour la pepsine mais par contre ça marche pour la chymotrypsine puisque la Proline est avant
J'espère que ça va t'aider et que je me suis pas trompé
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marieprati
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merci beaucoup
[quote="Niss"]
Salut, Je suis pas tutrice mais je vais quand même essayé de t'expliquer
Oui en fait les endopeptidases ne peuvent pas couper APRES une proline (P)
Petit rappel:
Pepsine -> Coupe à gauche les aa donc inactive si proline AVANT les aa
Trypsine et Chymotrypsine -> coupent à droite les aa donc inactive si proline APRES les aa
Ex: R-P-F-W-P la pepsine donne -> R-P-F-|W-P du coup on obtient 2 fragments
Même exemple mais avec la chymotrypsine -> R-P-F|-W-P pareil on obtient 2 fragments
Je t'ai mis en rouge où la proline empêche le clivage du peptide
Du coup pour ton 1er exemple c'est juste uniquement si X n'est pas la proline
Pour ton 2ème exemple ça ne coupera pas pour la pepsine mais par contre ça marche pour la chymotrypsine puisque la Proline est avant
J'espère que ça va t'aider et que je me suis pas trompé
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[quote="Niss"]
Salut, Je suis pas tutrice mais je vais quand même essayé de t'expliquer
Oui en fait les endopeptidases ne peuvent pas couper APRES une proline (P)
Petit rappel:
Pepsine -> Coupe à gauche les aa donc inactive si proline AVANT les aa
Trypsine et Chymotrypsine -> coupent à droite les aa donc inactive si proline APRES les aa
Ex: R-P-F-W-P la pepsine donne -> R-P-F-|W-P du coup on obtient 2 fragments
Même exemple mais avec la chymotrypsine -> R-P-F|-W-P pareil on obtient 2 fragments
Je t'ai mis en rouge où la proline empêche le clivage du peptide
Du coup pour ton 1er exemple c'est juste uniquement si X n'est pas la proline
Pour ton 2ème exemple ça ne coupera pas pour la pepsine mais par contre ça marche pour la chymotrypsine puisque la Proline est avant
J'espère que ça va t'aider et que je me suis pas trompé
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