ED n°2

[GGpaces]

Bonjour,
est-ce-que quelqu'un peut m'expliquer pourquoi dans l'expérience 1, question 1, le premier aa est la méthionine? 
et pour l'expérience 2 question 3, comment peut-on savoir si l'anticorps anti Pex16 reconnait un épitope cytosolique ou un épitope matriciel ?
et dernière question: dans quel cours de bioC a été dit que SKL est une séquence spécifique de PTS1? 
PLEASE.

[Jade]

Salut, alors selon moi : 
 
1) le premier AA des protéines est toujours la méthionine et comme ta protéine n'a pas été clivée on sait que le premier AA est toujours la méthionine
 
2) quand tu regardes le schéma tu vois que dans le cas de la trypsine il manque la partie cytosolique qui a été digérée par la trypsine. Or sur le WB tu vois qu'en présence de trypsine on détecte quand même la protéine. Cela signifie que l'anticorps reconnait un épitope matriciel car dans le cas d'un épitope cytosolique on aurait pas de marquage de la protéine sur le WB puisque la partie cytosolique a été digérée par la trypsine
 
3) dans la partie "l'adressage des protéines dépend d'un signal défini dans leur séquence peptidique mais pas uniquement" du cours du cytosol elle a parlé de PTS1, de NLS, de la séquence KDEL.. Moi non plus j'avais pas SKL dans mon cours donc je ne sais pas mais perso je l'ai rajouté au crayon gris à cet endroit là 

[GGpaces]

[quote="Jade"]
Salut, alors selon moi : 
 
1) le premier AA des protéines est toujours la méthionine et comme ta protéine n'a pas été clivée on sait que le premier AA est toujours la méthionine
 
2) quand tu regardes le schéma tu vois que dans le cas de la trypsine il manque la partie cytosolique qui a été digérée par la trypsine. Or sur le WB tu vois qu'en présence de trypsine on détecte quand même la protéine. Cela signifie que l'anticorps reconnait un épitope matriciel car dans le cas d'un épitope cytosolique on aurait pas de marquage de la protéine sur le WB puisque la partie cytosolique a été digérée par la trypsine
 
3) dans la partie "l'adressage des protéines dépend d'un signal défini dans leur séquence peptidique mais pas uniquement" du cours du cytosol elle a parlé de PTS1, de NLS, de la séquence KDEL.. Moi non plus j'avais pas SKL dans mon cours donc je ne sais pas mais perso je l'ai rajouté au crayon gris à cet endroit là 
[/quote]
Merci   

[Thomas Bouyoux]

Salut
Je viens confirmer les réponses :
1) Tu verras plus tard en UE1 que chez les eurcaryotes, le 1er AA est effectivement toujours une méthionine
2) J'ai pas l'ED donc j'espère que l'explication de Jade te vas
3) Je ne sais pas exactement où vous en êtes en bio c mais en tout cas on devrait t'en parler dans le chapitre sur le peroxysome

[enilorac]

Pour la 3 elle a dit hyper rapidement dans le peroxisome, j'étais en cours j'écoutais et pourtant j'avais mm pas capté c'est ma pote qui me l'a dit ^^