Savoir calculer les fragment de peptides.

[Gratier]

Bonjour, 
 
J'ai pu constater que dans pas mal d'annales, même pratiquement tous les ans, le même item tombe chaque année ! 
 
Il s'agit de savoir faire la fragmentation. Hors je ne comprends pas du tout comment il faut faire pour pouvoir répondre  correctement !!! 
 
J'ai pris un exemple de l'annale de l'année dernière 
 
"L'action du bromure de cyanogène sur le peptide A L S P M GA K C F M S Y P R W A G libère 3 fragments." 
 
La réponse est juste et ils nous disent parce qu'il coupe en "m". 
 
Mais pourquoi et comment on fait ??? 

[Dr House]

Bonsoir,
 

• Produit chimique :  

 

1. Bromure de cyanogène : Br-CN : coupe la liaison engageant le carboxyle de la Met (à droite).

 

•  Produits enzymatiques (endopeptidases gastriques ou pancréatiques) :  

 

1. Trypsine (pancréatique) : coupe la liaison engageant le carboxyle d’une Arg ou d’une Lys. Elle est inactive s’il y a une proline après Arg et Lys (à droite).
2. Chymotrypsine (pancréatique) : coupe la liaison engageant le carboxyle d’un acide aminé aromatique (à droite) : Phe, Tyr, Trp. Elle est inactive s’il y a une proline après.
3. Pepsine (estomac) : coupe la liaison engageant l’amine d’un acide aminé aromatique (F, Y, W), à gauche des aromatiques. Elle est inactive s’il y a une proline après ces AA.

[Dr House]

Si on considère l'exemple qui provient des annales :
 
<blockquote class="ipsBlockquote">L'action du bromure de cyanogène sur le peptide A L S P M GA K C F M S Y P R W A G libère 3 fragments.
 
</blockquote>
 
[font=Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;background-color:rgb(245,245,245)]Tu coupes à chaque aminoacide Met (M) à droite.[/font]
 
[font=Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;background-color:rgb(245,245,245)]Bonne soirée.[/font]