Enzymo > PAM

[sirinky]

Bonjour,

Alors en fait j'ai pas compris le principe de la PAM? Elle catalyse la réaction d alpha amidation. Elle a 2 activités (hydroxylation et lyase qui se fait à ph basique ) mais dans le cours dernier le prof a dit que la réaction totale se fait à ph ACIDE ? Comment est ce possible ?

de plus après c'est dit que l'hydrolyse de l'amidon est à ph neutre puis l'activité de l'enzyme damidation à une activité max à 7,5 <ph < 8,5

Et de plus a quoi sert lexopeptidase dans tt sa ?? ://

Pouvez vous m'éclairer svp


Et derniere question est ce qu'on peut dire qu'un holoenzyme = cofacteur vu que qu'un holoenzyme est soit un ion métallique soit un coenzyme ? Sa revient à être un cofacteur non ?


Merci d'avance

[FTM]

L'holoenzyme c'est le cofacteur (partie non protéique, ion métallique ou molécules organiques que l'on appelle aussi coenzyme) + l'apoenzyme (partie protéique de l'enzyme).
 
L'exopeptidase sert à cliver une chaîne protéique à ce que j'ai compris des explications du prof
 
Et pour ta question sur la PAM,  je ne répondrais pas parce que je n'ai pas envie de dire de conneries

[kev13011]

Petite précision, il me semble qu'uune exopeptidase elle clive un acide aminé en bout de chaîne, tandis qu'une endopeptidase elle clive à un endroit en plein milieu de la chaîne
 
Donc l'exopeptidase et l'endopeptidase elles servent à faire en sorte que la glycine soit en bout de chaîne, pour être reconnu par la PAM

[sirinky]

Merci pour vos précisions sa m'aide déjà bien

[Éridan]

Salut,
 
http://www.ipubli.inserm.fr/bitstream/handle/10608/4481/MS_1991_9_927.pdf?sequence=1
 
Article de Ouafik d'où est tiré le cours. J'espère que tu y trouveras les réponses que tu cherches.

[Mannose]

Pour amider un peptide en C-terminal, il y a deux réactions, chacune catalysée par une enzyme différente, ces deux enzymes étant associées dans la PAM :

• Hydroxylation du carbone alpha de la glycine.
• Rupture de la liaison entre le carbone alpha de la glycine et la fonction amine de la glycine.

La première réaction est catalysée par la PHM.
La deuxième réaction (rupture de la liaison) peut s'effectuer spontanément à pH très basique, mais dans les conditions physiologiques (pH neutre ou acide), elle doit être catalysée par la PAL.
 
Le pH optimum de l'enzyme d'amidation varie entre 4 et 9 en fonction de la nature de l'acide aminé qui précède la Glycine. 
Si c'est un AA acide --> pH optimum bas.
Si c'est un AA basique --> pH optimum élevé.
 
Edit : ah merde je me suis fait devancer dans mon copiage de Ouafik

[Epic Benji]

Il a parlé du pH optimum de l'enzyme d'amidation ? Enfin je me perds peut être dans mes cours.
 
L'hydrolyse de l'amidon, ça n'a pas de rapport avec l'enzyme d'amidation on est d'accord ?

[sirinky]

Merci de vos réponses je pense avoir compris

[just]

Bonsoir !
j'aimerais savoir quels sont les cofacteurs de la PAM exactement s'il vous plait

[Lauure]

Ascorbate O2  et le cuivre de sur !!!!  et cette année en lousdé il a rajouté le zinc(le matin) ! Mais rien de tout ça dans son article je comptais lui poser la question à son prochain cours ! 
 
Si il y a des gens de l'apreme qui passe par là j'aimerai bien savoir si il a parlé de zinc ?